#NEXUS [Ms475 family after inclusion of EL 2,8,9,10; 1/12/99] Begin data; Dimensions ntax=13 nchar=1500; Format datatype=DNA interleave gap=- matchchar=.; Matrix [ ' 5900 ' ' ' ] Ms475node AAGATCGAGA ATTGACAAAT GGGACCTAAT AAAACTCCAA AGTTTCTGCA L1mda2 .......... ..c....... .......... g.....g... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... g......... .......... Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 5950 ' ' ' ] Ms475node AGGCAAAAGA CACTGTCAAT AAGACAAAAA GACCACCAAC GGAATGGGAA L1mda2 .......... .......... .......... .......... a..t...... Tfnode2 .......... .......t.. .......... .......... a..c...... Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6000 ' ' ' ] Ms475node AGGATCTTTA CCTATCCTAA ATCAGATAGG GGACTAATAT CCAACATATA L1mda2 .......... .......... .......... .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6050 ' ' ' ] Ms475node TAAAGAACTC AAGAAGGTGG ACCTCAGAAA ATCAAATAAC CCCCTTAAAA L1mda2 .......... .......... ..t....... .......... ...a...... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6100 ' ' ' ] Ms475node AATGGGGCTC AGAACTGAAC AAAGAATTCT CACCTGAGGA ATACCGAATG L1mda2 .......... .......... .......... ....c..... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf ---------- ---------- -----..... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6150 ' ' ' ] Ms475node GCAGAGAAGC ACCTGAAAAA ATGTTCAACA TCTTTAATCA TCAGGGAAAT L1mda2 .......... ..t....... .......... .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 ---------- ---------- ---------- -------... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6200 ' ' ' ] Ms475node GCAAATCAAA ACAACCCTGA GATTCCACCT CACACCAGTG AGAATGGCTA L1mda2 .......... .......... .......... .........c .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .a........ El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6250 ' ' ' ] Ms475node AGATCAAAAA TTCAGGTGAC AGCAGATGCT GGCGTGGATG TGGAGAAAGA L1mda2 .......... .......... .......... ....a..... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... ....a..... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6300 ' ' ' ] Ms475node GGAACACTCC TCCATTGTTG GTGGGATTGC AGGCTTGTAC AACCACTCTG L1mda2 .......... .......... ......g... .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... ......---- ---....... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6350 ' ' ' ] Ms475node GAAATCAGTC TGGCGGTTCC TCAGAAAATT GGACATAGTA CTACCGGAGG L1mda2 .......... .......... ........c. .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... ...t...... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6400 ' ' ' ] Ms475node ATCCAGCAAT ACCTCTCCTG GGCATATATC CAGAAGAAGC CCCAACTGGT L1mda2 .......... .......... .......... .......t.. ......a... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6450 ' ' ' ] Ms475node AAGAAGGACA CATGCTCCAC TATGTTCATA GCAGCCTTAT TTATAATAGC L1mda2 .......... .......... .......... .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6500 ' ' ' ] Ms475node CAGAAACTGG AAAGAACCCA GATGCCCCTC AACAGAGGAA TGGATACAGA L1mda2 .....g.... ........t. .......... .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6550 ' ' ' ] Ms475node AAATGTGGTA CATCTACACA ATGGAGTACT ACTCAGCTAT TAAAAAGAAT L1mda2 .......... .......... .......... .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- [ ' 6600 ' ' ' ] Ms475node GAATTTATGA AATTCCTAGC CAAATGGATG GACCTGGAGA GCATCATCCT L1mda2 .......... .......... .......... .........g .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... ..c....... .......... .........g .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 ---------- ---------- ---------- ----...... .......... Sk6 ---------- ---------- ---------- ----...... .......... Sk23 ---------- ---------- ---------- ----...... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ------.... [ ' 6650 ' ' ' ] Ms475node GAGTGAGGTA ACACATTCAC AAAGGAACTC ACACAATATG TACTCACTGA L1mda2 .......... .......... ....a..... .......... ..t....... Tfnode2 .......... .....a.... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......t.. .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 6700 ' ' ' ] Ms475node TAAGTGGATA TTAGCCCAAA ACCTAGGATA CCCACGATAT AAGATACAAT L1mda2 .......... .......c.. .......... ....a..... ......t... Tfnode2 .......... c......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 6750 ' ' ' ] Ms475node TTCCTAAACA CATGAAACCC AAGAAAAATG AAGACTGAAG TGTGGACACT L1mda2 ..g....... ........t. ...g.g.... .......... .......... Tfnode2 .......... ........t. .......... .......... .......... Saf .......... ........t. .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 6800 ' ' ' ] Ms475node ATGCCCCCTC CTTAGAAGTG GG-AAAAAAA CACCCATGGA AGGAGTTACA L1mda2 ...-...... ......tt.. ..-..c.... .......... .......... Tfnode2 ...-...... .......... ..-..c.... .......... .......... Saf ...-...... .......... ..-..c.... .......... .......... El2uf .......... .......... ..-....... .......... .......... El10 .......... .......... ..-....... .......... .......... El9 .......... .......... ..-....... .......... .......... El8 .......... .......... ..-....... .......... .......... Sk2 .......... .......... ..-....... .......... .......... Sk6 .......... .......... ..-....... .......... .......... Sk23 .......... .......... ..-....... .......... .......... El111 .......... .......... ..a....... .......... .......... Pl3uf .......... .......... ..-....... .......... .......... [ ' 6850 ' ' ' ] Ms475node GAAACAAAGT TTGGAGCCGA CATGAAAGGA TGGACCATAT AGAGACTGCC L1mda2 ..g..gg... .......t.. g......... ........g. .......... Tfnode2 .......... .......t.. g......... ........g. .......... Saf .......... .......t.. g......... ........g. .......... El2uf .......... .......... .......... ......---- ---------- El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......t.. .......... .......... .......... [ ' 6900 ' ' ' ] Ms475node ATATACAGGG ATCCACCCCA TAATCAGCAT CCAAATGCTG ACACCATTGC L1mda2 ...gc..... .......... .......... .....c.... .......... Tfnode2 ....c..... .......... .......... .....c.... .......... Saf ....c..... .......... .......... .......... .......... El2uf -------... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 ....c..... .......... .......... .......... .......... Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ....c..... .......... .......... .......... .......... [ ' 6950 ' ' ' ] Ms475node ACACACTAGC AAGATTTTAC TGAAAGGACC CAGATGTAGC TGTCTCATGT L1mda2 .t........ .........t .........g .......... ......t... Tfnode2 .t.t...... .........t c......... .......... ......t... Saf .t........ .......... .......g.. .......... ......t... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... ......t... [ ' 7000 ' ' ' ] Ms475node GAGACTATGC CGGGGCCTAG CAAACACAGA AGTGGATGCT CACAGTCAGC L1mda2 .......... .......c.. .......... .......... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... ....-..... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 7050 ' ' ' ] Ms475node TAATGGATGG ATCACAGGGC TCCCAATGGA GGAGCTAGAG AAAGTACCCA L1mda2 .......... ....t..... .......... .......... ......g... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......... .......... .......... El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 7100 ' ' ' ] Ms475node AGGAGCTAAA GGGATCTTCA ACCCTATAGG TGGAACAACA TTATGAACTA L1mda2 .......... .......g.. .......... .......... ......g... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf .......... .......... .......--- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 .......... .......... .......... .......... .......... Sk6 .......... .......... .......... .......... .......... Sk23 .......... .......... .......... .......... .......... El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 7150 ' ' ' ] Ms475node ACCAGTACCC CTGAGCTCTT GACTCTAGCT GCATATGTAT CAAAAGATGG L1mda2 .......... .g........ .......... ......a... .......... Tfnode2 .......... .......... .......... .......... .......... Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 .......... ........-- ---------- ---------- ---------- Sk6 .......... ........-- ---------- ---------- ---------- Sk23 .......... ........-- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 7200 ' ' ' ] Ms475node CCTAGTCGGC CATCAATGGA AAGAGAGGCC CATTGGACAC GCAAACTTTA L1mda2 .......... .....c.... .......... ........tt .......... Tfnode2 .......... .....c.... .......... .......... ...g.....g Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 7250 ' ' ' ] Ms475node TATGCCCCAG TACAGGGGAA CGCCAGGGCC GAAAAGGGGG AGTGGGTGGG L1mda2 .......... .......... ta........ a......... .......... Tfnode2 .g......g. .......... .......... a..gg..... .......... Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... .......... [ ' 7300 ' ' ' ] Ms475node TAGGGGAGTG GGGGTGGGTG GGTATGGGGG ACTTTTGGTA TAGCATTGGA L1mda2 c......... .......... .a........ .......... .......... Tfnode2 .......... .......... ....a..... .......... .......... Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... .......... El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .......... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .......... Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf .......... .......... .......... .......... ---------- [ ' 7350 ' ' ' ] Ms475node AATGTAAATG AGCTAAATAC CTAATAAAAA ATGGGAAAAA AAAAAAAAAA L1mda2 .......... ..t....... .......... ....a..... .--------- Tfnode2 .......... .......... .......... ....a..... .......--- Saf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El2uf .......... .......... .......... .......... ...------- El10 .......... .......... .......... .......... .......... El9 .......... .......... .......... .....g.... .......... El8 .......... .......... .......... .......... .....gg... Sk2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Sk23 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- El111 .......... .......... .......... .......... .......... Pl3uf ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ; End;