T-COFFEE, Version_1.37(Wed Jul 11 14:38:06 PDT 2001)
Notredame, Higgins, Heringa, JMB(302)pp205-217,2000
CPU TIME:0 sec.
SCORE=81
*
 BAD AVG GOOD
*
1ajsA        :  82
aatc_yeast   :  81
aat2_arath   :  83
aatm_human   :  82
aatm_lupan   :  80
aat_haein    :  83
aat_ecoli    :  80
tyrb_ecoli   :  79
phhc_pseae   :  79

1ajsA        -------WVLPVVRKVEQRIANNSSLNHEYLPILGLAEFRTCASRLALGDDSPALQEKRV
aatc_yeast   RDDNGKPWVLPSVKAAEKLIHNDSSYNHEYLGITGLPSLTSNAAKIIFGTQSDAFQEDRV
aat2_arath   RTEEGKPLVLDVVRKAEQQLVNDPSRVKEYIPIVGISDFNKLSAKLILGADSPAITESRV
aatm_human   RDDNGKPYVLPSVRKAEAQIAA-KNLDKEYLPIGGLAEFCKASAELALGENSEVLKSGRF
aatm_lupan   RTEELQPYVLKVVNKAENLML-ERGQNKEYLAIEGLAAFNKATAELLLGADNPAIKQQRV
aat_haein    KDAQGTTPIMHAVKEAEKRLFDKEK-TKNYLTIDGIADYNEQTKALLFGKDSEVIQSNRA
aat_ecoli    KDETGKTPVLTSVKKAEQYLLENET-TKNYLGIDGIPEFGRCTQELLFGKGSALINDKRA
tyrb_ecoli   YNEDGIIPQLQAVAEAEARLNAQPHGASLYLPMEGLNCYRHAIAPLLFGADHPVLKQQRV
phhc_pseae   KDAQGLTPILRSVKLAEQRLVEQET-TKSYVGGHGDALFAARLAELALGAASPLLLEQRA

Cons                  :  *  .*  :         *:   *          : :*     : . * 


1ajsA        GGVQSLGGTGALRIGAEFLARWYNGTNNKDTPVYVSSPTWENHNGVFTTAGFKDIRSYRY
aatc_yeast   ISVQSLSGTGALHISAKFFSKFFPDK-----LVYLSKPTWANHMAIFENQGLK-TATYPY
aat2_arath   TTVQCLSGTGSLRVGAEFLKTHYHQS-----VIYIPKPTWGNHPKVFNLAGLS-VEYFRY
aatm_human   VTVQTISGTGALRIGASFLQRFFKFS----RDVFLPKPTWGNHTPIFRDAGMQ-LQGYRY
aatm_lupan   ATVQGLSGTGSLRLGAALIERYFPGA-----KVLISAPTWGNHKNIFNDARVP-WSEYRY
aat_haein    RTVQSLGGTGALRIAAEFIKRQTKAQ-----NVWISTPTWPNHNAIFNAVGMT-IREYRY
aat_ecoli    RTAQTPGGTGALRVAADFLAKNTSVK-----RVWVSNPSWPNHKSVFNSAGLE-VREYAY
tyrb_ecoli   ATIQTLGGSGALKVGADFLKRYFPES-----GVWVSDPTWENHVAIFAGAGFE-VSTYPW
phhc_pseae   DATQTPGGTGALRLAGDFIAHCLPGR-----GIWLSDPTWPIHETLFAAAGLK-VSHYPY

Cons            *  .*:*:*::.. ::             : :. *:*  *  :*    .     : :


1ajsA        WDTEKRGLDLQGFLSDLENAPEFSIFVLHACAHNPTGTDPTPEQWKQIASVMKRRFLFPF
aatc_yeast   WANETKSLDLNGFLNAIQKAPEGSIFVLHSCAHNPTGLDPTSEQWVQIVDAIASKNHIAL
aat2_arath   YDPATRGLDFKGLLEDLGAAPSGAIVLLHACAHNPTGVDPTSEQWEQIRQLMRSKSLLPF
aatm_human   YDPKTCGFDFTGAVEDISKIPEQSVLLLHACAHNPTGVDPRPEQWKEIATVVKKRNLFAF
aatm_lupan   YDPKTVGLDFEGMIEDIKAAPEGTFVLLHGCAHNPTGIDPTPEQWEKIADVIQEKNHIPF
aat_haein    YDAERKALDWEHLLEDLSQASEGDVVLLHGCCHNPTGIDPTPEQWQELAALSAKNGWLPL
aat_ecoli    YDAENHTLDFDALINSLNEAQAGDVVLFHGCCHNPTGIDPTLEQWQTLAQLSVEKGWLPL
tyrb_ecoli   YDEATNGVRFNDLLATLKTLPARSIVLLHPCCHNPTGADLTNDQWDAVIEILKARELIPF
phhc_pseae   VSADNR-LDVEAMLAGLERIPQGDVVLLHACCHNPTGFDLSHDDWRRVLDVVRRRELLPL

Cons                .     :  :       ..::* *.***** *   ::*  :      .  :.:


1ajsA        FDSAYQGFASGNLEKDAWAIRYFV---SEGFELFCAQSFSKNFGLYNERVG----NLTVV
aatc_yeast   FDTAYQGFATGDLDKDAYAVRLGVEKLSTVSPVFVCQSFAKNAGMYGERVGCFHLALTKQ
aat2_arath   FDSAYQGFASGSLDTDAQSVRTFV---ADGGECLIAQSYTKNMGLYGERVG----ALSIV
aatm_human   FDMAYQGFASGDGDKDAWAVRHFI---EQGINVCLCQSYAKNMGLYGERVG----AFTMV
aatm_lupan   FDVAYQGFASGSLDEDAASVRLFV---ARGLEVLVAQSYSKNLGLYAERIG----AINVI
aat_haein    FDFAYQGLANG-LDEDAYGLRAFA---ANHKELLVASSFSKNFGLYNERVG----AFTLV
aat_ecoli    FDFAYQGFARG-LEEDAEGLRAFA---AMHKELIVASSYSKNFGLYNERVG----ACTLV
tyrb_ecoli   LDIAYQGFGAG-MEEDAYAIRAIA---SAGLPALVSNSFSKIFSLYGERVG----GLSVM
phhc_pseae   IDFAYQGFGDG-LEEDAWAVRLFA---GELPEVLVTSSCSKNFGLYRDRVG----ALIVC

Cons         :* ****:. *  : ** .:*               .* :*  .:* :*:*         


1ajsA        AKEPDSILRVLSQMQKIVRVTWSNPPAQGARIVARTLSDPELFHEWTGNVKTMADRILSM
aatc_yeast   AQNKTIKPAVTSQLAKIIRSEVSNPPAYGAKIVAKLLETPELTEQWHKDMVTMSSRITKM
aat2_arath   CKSADVASKVESQVKLVVRPMYSSPPIHGASIVATILKSSDMYNNWTIELKEMADRIKSM
aatm_human   CKDADEAKRVESQLKILIRPMYSNPPLNGARIAAAILNTPDLRKQWLQEVKGMADRIIGM
aatm_lupan   SSSPESAARVKSQLKRIARPMYSNPPVHGARIVADIVGNPALFDEWKVEMEMMAGRIKNV
aat_haein    AENAEIASTSLTQVKSIIRTLYSNPASHGGATVATVLNDAQLRQEWENELTEMRERIKKM
aat_ecoli    AADSETVDRAFSQMKAAIRANYSNPPAHGASVVATILSNDALRAIWEQELTDMRQRIQRM
tyrb_ecoli   CEDAEAAGRVLGQLKATVRRNYSSPPNFGAQVVAAVLNDEALKASWLAEVEEMRTRILAM
phhc_pseae   AQNAEKLTDLRSQLAFLARNLWSTPPAHGAEVVAAILGDSELKGLWQEEVEGMRSRIASL

Cons         . .         *:    *   *.*.  *.  .*  :    :   *  ::  *  **  :


1ajsA        RSELRARLEALK-TPGTWNHITDQIGMFSFTGLNPKQVEYLINQKHIYLLPSGRINMCGL
aatc_yeast   RHALRDHLVKLG-TPGNWDHIVNQCGMFSFTGLTPQMVKRLEETHAVYLVASGRASIAGL
aat2_arath   RQQLFEAIQARG-TPGDWSHIIKQIGMFTFTGLNKEQVEFMTKEFHIYMTSDGRISMAGL
aatm_human   RTQLVSNLKKEG-STHNWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVERLIKEFSIYMTKDGRISVAGV
aatm_lupan   RQQLYDSISSKDKSGKDWSFILKQIGMFSYTGLNKNQSDNMTNKWHVYMTKDGRISLAGL
aat_haein    RHLFVQLLKEYG-AEQDFSFIIEQNGMFSFSGLTGEQVDRLKNEFAIYAVRSGRINVAGI
aat_ecoli    RQLFVNTLQEKG-ANRDFSFIIKQNGMFSFSGLTKEQVLRLREEFGVYAVASGRVNVAGM
tyrb_ecoli   RQELVKVLSTEM-PERNFDYLLNQRGMFSYTGLSAAQVDRLREEFGVYLIASGRMCVAGL
phhc_pseae   RIGLVEALAPHG-LAERFAHVGAQRGMFSYTGLSPQQVARLRDEHAVYLVSSGRANVAGL

Cons         *  :   :         : .:  * *** ::**.      : .   :*   .**  :.*:


1ajsA        TTKNLDYVATSIHEAVTKIQ
aatc_yeast   NQGNVEYVAKAIDEVV----
aat2_arath   SSKTVPHLADAMHAAVTRL-
aatm_human   TSSNVGYLAHAIHQVTK---
aatm_lupan   SLAKCEYLADAIIDSFHYVS
aat_haein    TEDNIRYLCESIVKVL----
aat_ecoli    TPDNMAPLCEAIVAVL----
tyrb_ecoli   NTANVQRVAKAFAAVM----
phhc_pseae   HARRLGRLAQAIAQ------

Cons                :. ::